W MGS2 na PS2 jest właśnie pytanie, czy grałeś w poprzednią część czy nie; jeżeli zaznaczyłeś, że grałeś - zaczynasz od scenariusza Tanker, gdzie zostajesz od razu, jako Snake, rzucony na głęboką wodę.
Jeżeli zaznaczyłeś, że nie - zaczynasz od scenariusza Big Shell, gdzie gracz, niczym Raiden, traktowany jest jak totalny noob, któremu trzeba wszystko tłumaczyć i pokazywać. Dodatkowo, jako że nie widziałeś wydarzeń z tankowca na własne oczy, niczym Raiden masz prawo wierzyć we wszystko to, co inni Ci mówią (czyli, że Snake zabił wtedy Dolpha, że to Snake zatopił tankowiec i tam zginął itp itd.).
