A tą reinstalację musisz robić za każdym razem, gdy chcesz uruchomić program, czy tylko raz, a potem działa już dobrze?
Jeżeli to pierwsze, to podejrzewam wirusa albo psujący się dysk. Ewentualnie jakiś program do czyszczenia może coś usuwać z rejestru, czego nie powinien ruszać (chociaż Tune Up nic takiego nie robi).
W pierwszej kolejności sprawdz jakimś dobrym antywirusem (Kaspersky, NOD32) czy system jest czysty; jeżeli jest, to sprawdź dysk.